引起牙周炎的原因是什么?牙周炎和牙龈萎缩，就像一对连体婴儿，存在着必然的因果关系。因此连许多口腔科专业医生，也未必能说明是先有牙周炎，还是先有牙龈萎缩，牙齿黄金专家组经过多年的研究发现，牙龈萎缩是引起牙周炎的直接原因。
早期的轻微牙龈萎缩，会导致紧密包裹牙齿的天然屏障出现缝隙，成为牙石进入龈下的缺口，牙龈与牙齿之间出现缝隙，等于牙周组织(主要是包裹牙根的牙龈组织——内牙龈的萎缩)的保护屏障被打开，牙石渐渐向牙根深处滋长，称为“龈下结石”。
这些龈下结石成为口腔中各种细菌(尤其是厌氧菌)滋生的温床，不断滋生的牙周病菌直接侵袭牙周组织引起牙周炎。而牙周炎又会反过来加剧牙龈萎缩的恶化，加速牙槽骨被吸收，这种相互关系的恶性循环，导致牙龈水平下降、牙缝增大、牙根外露、牙齿松动，其结果不仅是摧毁牙龈健康，毁灭牙齿。也正因如此，很难分清究竟是牙周炎引起了牙龈萎缩，还是牙龈萎缩引起了牙周炎。
同时因为口腔科一直无法解释牙龈萎缩是如何形成的，只知道是由于牙龈缺乏维生素C。由于牙周炎和牙龈萎缩正如我们前面所描述的如孪生兄弟的关系，所以，干脆将牙龈萎缩归咎于是牙周炎引起的，颠倒了牙周炎和牙龈萎缩的因果关系。
所以，口腔科通常将牙周炎的形成，归咎于口腔清洁习惯不好喝刷牙习惯不对，从而不可避免的坠入了对牙周炎成因认识的误区。
目前对于牙周炎起因源自口腔清洁习惯和刷牙方式不对的结论，却明显难以解释以下现象：为什么许多甚至从不刷牙的人，也不会出现牙龈萎缩?还有一个随处可见的现象，就是通常对刷牙有抵触，刷牙方法和质量明显都比成年人差的青少年，却几乎不会出现牙龈萎缩和牙周炎呢?而对于已经出现牙周炎并高度重视，已经很认真去刷牙的成年人，却无法避免牙周炎继续恶化呢?
以上事实证明，口腔清洁习惯及刷牙方法，明显不是引起牙周炎的主要原因，只能算是一种诱因，引起牙周炎的真正原因是牙龈萎缩，正因为如此，也决定了单凭刮治和刷牙，是无法令牙周炎消失的。
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